Cada Comité Permanente está encabezado por un Director Internacional, que cuenta con el apoyo de un Equipo Internacional que generalmente consta de un Oficial de Enlace (que es responsable de la comunicación con Colaboradores Externos relevantes) y cinco Asistentes Regionales (uno de cada una de las cinco regiones de IFMSA). A nivel nacional, el Comité Permanente es coordinado por el Oficial Nacional, que es elegido durante la Asamblea Nacional Nacional de Octubre. A nivel local, el trabajo es ejecutado por uno o más oficiales locales.

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El trabajo de cada comité permanente se logra a través de varias actividades, como entrenamientos, campañas y actividades de abogacía, que ofrecen a los jóvenes un espacio para aprender en entornos educativos tanto formales como no formales. Miles de proyectos, actividades, conferencias y talleres se organizan cada año a nivel internacional, nacional y local a través de las Organizaciones Miembros Nacionales dentro de la red IFMSA en cada área, lo que permite a los estudiantes convertirse en agentes de cambio a nivel local.